Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rft1Q8C3B8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rft1Q8C3B8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms