Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps13cQ8BX70 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms