Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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