Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APTXQ7Z2E3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APTXQ7Z2E3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms