Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr2Q62312 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfbr2Q62312 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms