Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UVSSAQ2YD98 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms