Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GabpaQ00422 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms