Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vgll3P85442 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll3P85442 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms