Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtnP63089 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtnP63089 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtnP63089 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtnP63089 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtnP63089 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtnP63089 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtnP63089 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms