Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P10404 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P10404 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P10404 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P10404 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P10404 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P10404 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms