Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc62E9PVD1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc62E9PVD1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms