Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4950D3YUM8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms