Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cspp1B2RX88 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cspp1B2RX88 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms