Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms