Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Usp9yF8VPU6 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms