Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Syngr4Q9Z1L2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr4Q9Z1L2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms