Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ramp3Q9WUP1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ramp3Q9WUP1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms