Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2bQ9JME9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2bQ9JME9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms