Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc38a3Q9DCP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms