Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrotQ9DC50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrotQ9DC50 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms