Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms