Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ergic3Q9CQE7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ergic3Q9CQE7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms