Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nek8Q91ZR4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek8Q91ZR4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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