Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf3aQ8VHT7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3aQ8VHT7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms