Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf628Q8CJ78 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms