Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ercc8Q8CFD5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ercc8Q8CFD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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