Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms