Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup62Q63850 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms