Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga6Q61739 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga6Q61739 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms