Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd47Q61735 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd47Q61735 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms