Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933416C03RikQ3V063 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933416C03RikQ3V063 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms