Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbrg1Q3UB74 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms