Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms