Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 SWF1YDR126W 1011 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YER135CYER135C 393 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 PET54YGR222W 882 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YIL141WYIL141W 390 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 AFB1YLR040C 675 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YLR076CYLR076C 423 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YOL114CYOL114C 609 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RPA135YPR010C 3612 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 MDM36YPR083W 1740 nt3.63□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 REG1YDR028C 3045 nt3.62□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YCR064CYCR064C 411 nt3.62□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SMX2YFL017W-A 234 nt3.62□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 HHF2YNL030W 312 nt3.62□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SRP68YPL243W 1800 nt3.62□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SHS1YDL225W 1656 nt3.62□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 PEX6YNL329C 3093 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SNA4YDL123W 423 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 HNT1YDL125C 477 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 MIC19YFR011C 513 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YGR107WYGR107W 450 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 MVB12YGR206W 306 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 BET3YKR068C 582 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YML108WYML108W 318 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RSM19YNR037C 276 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 LTP1YPR073C 486 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 MPS1YDL028C 2295 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 CHS3YBR023C 3498 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 TSC11YER093C 4293 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 MSH2YOL090W 2895 nt3.61□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YPS6YIR039C 1614 nt3.6□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.6□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 CRG1YHR209W 876 nt3.6□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RAD33YML011C 534 nt3.6□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YNL146WYNL146W 303 nt3.6□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 STI1YOR027W 1770 nt3.6□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 CDH1YGL003C 1701 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SMC2YFR031C 3513 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 MYO5YMR109W 3660 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 SYO1YDL063C 1863 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 RCY1YJL204C 2523 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YOR105WYOR105W 327 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 YBR285WYBR285W 435 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 TGL3YMR313C 1929 nt3.59□□□□□ -1.83
CLF1Q12309 HFM1YGL251C 3564 nt3.59□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 TIF4631YGR162W 2859 nt3.59□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 UTP15YMR093W 1542 nt3.59□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SPO71YDR104C 3738 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 PPN1YDR452W 2025 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 IRC2YDR112W 309 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YHR212CYHR212C 336 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YJL086CYJL086C 369 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SPC1YJR010C-A 285 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YAR060CYAR060C 336 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YLR287CYLR287C 1068 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YPL034WYPL034W 498 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YPL185WYPL185W 396 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 snR54snR54 86 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SIZ1YDR409W 2715 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YAT2YER024W 2772 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 HBT1YDL223C 3141 nt3.58□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 MDM1YML104C 3384 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 POL4YCR014C 1749 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 FMN1YDR236C 657 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 GDI1YER136W 1356 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RNP1YLL046C 750 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 APC9YLR102C 798 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 GYL1YMR192W 2163 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RIO2YNL207W 1278 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RRI2YOL117W 1938 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 IRC16YPR038W 360 nt3.57□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 PKH1YDR490C 2301 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YCG1YDR325W 3108 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RTS3YGR161C 792 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RPL15AYLR029C 615 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RIM9YMR063W 720 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 MPD2YOL088C 834 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YOR277CYOR277C 309 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 TIM12YBR091C 330 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YJL132WYJL132W 2253 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 MUS81YDR386W 1899 nt3.56□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 DBF20YPR111W 1695 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 MDV1YJL112W 2145 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 DOA4YDR069C 2781 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YBR259WYBR259W 2067 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RMT2YDR465C 1239 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YFR054CYFR054C 579 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 ERV1YGR029W 570 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SDP1YIL113W 630 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 CWC24YLR323C 780 nt3.55□□□□□ -1.84
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