Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms