Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra1P97785 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra1P97785 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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