Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps28P62858 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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