Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP25P60880 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP25P60880 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms