Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd7P50283 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms