Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITPNBP48739 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms