Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11bP46638 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11bP46638 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms