Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP1P32455 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP1P32455 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP1P32455 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP1P32455 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP1P32455 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP1P32455 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP1P32455 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms