Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Casp1P29452 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casp1P29452 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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