Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NefhP19246 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NefhP19246 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NefhP19246 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NefhP19246 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NefhP19246 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NefhP19246 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms