Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRXO43186 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRXO43186 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRXO43186 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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