Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Q1O19441 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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H2-Q1O19441 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Q1O19441 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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H2-Q1O19441 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms