Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVH48-1M5A8F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms