Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccdc179J3QM76 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms