Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd35E9Q9D8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd35E9Q9D8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd35E9Q9D8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd35E9Q9D8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd35E9Q9D8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ankrd35E9Q9D8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd35E9Q9D8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms