Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnb1ip1D3Z3K2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms